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スクリーニング化合物High Throughput Screening Compounds

Fragment Library(フラグメントライブラリー)

Fragment Libraryとは?

Fragment Base Drug Design(FBDD)に最適な化合物ライブラリーです。
弱い活性を検知するために高濃度でアッセイが行われることを考慮して集められた化合物で構成されています。

サプライヤー 製品名 品目数 溶解性試験 特徴
AnalytiCon
(ドイツ)
Fragments From Nature 216 天然物をモチーフにデザインされたエナンチオピュアなフラグメント
Enamine
(ウクライナ)
Fragment Library 18,108 × ENAMINEのスクリーニング全品目よりRo3に基づいて選択
Golden Fragment Library 1,794 溶解性試験を行い、Fragment Libraryより高溶解性の物のみをダイバーシティー性を考慮して選択
Fluorinated Fragments 3,000 × フッ素を含むフラグメント
Brominated Fragments 1,280 × 臭素を含むフラグメント
PPI-fragments 1,470 × PPI FBDD 用に選択
Fsp3-enriched fragments 1,817 × Fsp3リッチで3D-shapeな構造を含むフラグメント
Feasible Fragment Library >465,000 × バーチャル品のフラグメント
ACB Blocks
(カナダ)
Fragment Library 1,280
(一部)
drug-likeなフラグメント
19F NMR-oriented Fragment Library 207
(一部)
フッ素を含むフラグメント
Asinex
(ロシア)
ASINEX Fragments 23,193
(一部)
Ro3に基づき選択された天然物ライクなフラグメント
Chem-X-infinity
(フランス)
FRAGMENT LIBRARY 1 1,156 × 1scaffoldあたり約10品目ずつRo3に基づきデザインされたフラグメント
Evoblocks
(ハンガリー)
Evoblocks Fragment Library 950 3D, Kinase, GPCR, Covalent Mappingを指向したフラグメント
HTS Biochemie
(ドイツ)
Fragment Library 2,074
(DMSO)
Ro3に基づいたフラグメント
Key Organics
(イギリス)
Full BIONET Fragments Library 26,086 × Ro3に基づいたフラグメント
2nd Generation Premium Fragment Library 1,166 Ro3、PAINSに基づき、ダイバーシティー性を考慮して選択
Fragments from Nature 183 Ro3に基づき、天然物モチーフと高い3次元形状の多様性を考慮して選択
Bromine Fragment Library 1,653 × 臭素を含むフラグメント
Premium Fluorine Fragment Library 500 フッ素を含むフラグメント
Chiral Cyclic Fragments 19 × キラル化合物を含むフラグメント
LifeChemicals
(ウクライナ)
General Fragments Library 34,398 × Ro3、PAINSに基づき選択されたフラグメント
Low MW Fragment Library 30,000 × 上限MW225という低い条件の下、構築したライブラリ
Superior Fragment Library 3,165 × Ro3、TPSA≦60Å2、PAINSに加え、独自の毒性フィルター基づき選択
Soluble Fragments with Experimental Data 9,734 高溶解性(DMSO、PBS buffer)の物のみを選択
Fsp3-enriched Fragment Library 8,615 × Ro3、TPSA≦90Å2に基づき選択されたFsp3リッチな構造を含むフラグメント
Fluorinated Fragment Library 2,973 × フッ素を含むフラグメント
Bromine-based Fragment Library 1,085 × 臭素を含むフラグメント
PPI Fragment Library 1,892 × PPI FBDD 用に選択された高いTPSA値、疎水性の構造を含むフラグメント
Covalent Fragment Library 1,296 × ターゲットのタンパクに共有結合をする特定構造のフラグメント
3D Fragment Library 1,512 × drug-likeの3次元性を持つよう、少なくとも1つのキラルセンターを持つフラグメント。
Tangible Fragment Library 24,901 × バーチャル品のフラグメント
Maybridge
(イギリス)
Ro3 Diversity Fragment Library 2,500 Ro3に基づいたフラグメント
OTAVA
(ウクライナ)
General Fragment Library 12,486 × Ro3に基づいたフラグメント
Fluorine-containing Fragment Library 1,217 × フッ素を含むフラグメント
Solubility Fragment Library 1,045 高溶解性(DMSO、PBS buffer)のみを選択
Chelator Fragment Library 1,023 × キレートグループを含むフラグメント
Halogen-enriched Fragment Library 618 × ハロゲン化合物を含むフラグメント
PharmaBlock
(中国)
carboxylic acid Library 738
(一部)
水溶性の高い芳香族カルボン酸と非芳香族カルボン酸を含むフラグメント
Vitas-M
(ロシア)
Fragment Library 18013 × Ro3に基づいたフラグメント
Zenobia※
(アメリカ)
Fragment Library 1 352 PPIを含む幅広いターゲットに活用が可能なフラグメント
Fragment Library 1+ 164 sp3性を指向した、PPIを含む幅広いターゲットに活用が可能なフラグメント
Fragment Library 2 288 Zenobia社品の内、最も高いsp3性を持つフラグメント
Fragment Library 2+ 170 タンパク表面の3次元構造への適合を指向した脂肪族のフラグメント

チェリーピック対応可能(1品目からご購入いただけます)
※Zenobia社はセット販売のみ

Fragmentを用いたアプローチの特徴
ドラッグライクネスの追及が最適化の中でしやすい。
多彩な組み合わせにより、大きなケミカルスペースを網羅する事が出来る。
知的財産権(IP)の確保がしやすい。

Fragment-Linking / Fragment-Merging / Fragment-Growth

市販Fragmet Libraryの特徴
弱い活性を検知するために高濃度でアッセイが行われることを考慮し、比較的高純度で、溶解性が分かっているセットも多数ございます。
NMRやX線結晶解析向けにFluoroやBromoが導入されたシリーズもございます。

主なサプライヤー紹介

Enamine
Enamine社について
スクリーニング化合物190万品目以上、BuildingBlocks7万品目以上と、他社を圧倒する保有化合物数を誇ります。その中からフィルタリング、官能基の選択、クラスタリング等、多段階の選択を経て厳選されたフラグメントライブラリを提供しております。
Key Organics
Key Organics社について
Key Organics社では『ケミストが面白いと思う構造を合成する』というモットーの基にスクリーニング化合物やBuilding Blocksを合成しております。その中から各種クライテリアによって選択されたフラグメントライブラリーは約半数が独自の構造を有しております。またX線やNMRなど様々な解析方法に合わせたフラグメントライブラリーもございます。
MAYBRIDGE
MAYBRIDGE社について
2009年5月、Cancer Research Technology(CRT)に販売実績あり(Fragment Collectionから選択をした2000品目)。品質・ヒット後のフォローアップに定評があります。
X線を用いた解析向きのBromoCollectionや、NMRを用いた解析向きのFluoroCollection等もございます。
AnalytiCon
AnalytiCon社について
天然物および天然物誘導体ライブラリで世界をリードするドイツの会社です。
Fragments from Natureは天 然物誘導体より選択されたキラル化合物となっており、溶解性の実測値・機器分析データのご提供も可能で、高い品質を保証致します。また、Hit後のフォローアップサービスも対応することが可能です。
Otava
Institude of Molecular Biology and Genetics of NAS Ukraine 内にラボを持つ、ウクライナのメーカーで、新規化合物を開発しコレクションを充実させるため、ロシア・ウクライナの研究所と共同開発をしています。
同社のフラグメントライブラリーは、Rule-of-Three、物理化学特性、構造特性に基づき自社コレクションから選択された化合物ライブラリーです。
CHEM-X-INFINITY
様々なターゲットライブラリを、オリジナルのスキャホールドからテーマに沿って自社合成している会社です。FragmentLibrary用に新たに自社で合成をした化合物をドライフィルムで提供しております。
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