ナミキ商事株式会社 医薬品及び創薬化学品の専門商社

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サプライヤー情報

Life Chemicals(ライフ ケミカルズ)

ウクライナ

  • スクリーニング化合物

Life Chemicals(ライフ ケミカルズ)社について

設立
2004年
社員数
100名
本社所在地
ウクライナ (キエフ)
URL
https://lifechemicals.com/

Life Chemicals Inc.は、オリジナルのHTS用化合物と先進的なBuilding Blocks及び関連した依頼合成やコンピュテーショナルケミストリーサービスを提供する、国際的にも認められたサプライヤーです。
化合物等の製造拠点はウクライナのキエフにあり、先進的な合成研究室として、高いスキルや研究能力を持つ従業員を100名以上持ち、内23名のPhDが在籍しております。

特徴
    • オリジナルのHTS用化合物とBuilding Blocks等が提供可能なサプライヤー
    • 2,000m²以上の生産サイトを保有

製品情報

Building Blocks
合成用試薬(ビルディングブロック)

品目数 62,000品目以上(内11,000品目が在庫品、50,000品目がバーチャル品)
毎月新しいBuilding Blocksが追加されています!!
※リクエストに応じ、バルク量での供給も対応が可能です。

Screening (HTS) Compounds
スクリーニング化合物

品目数 1,000,000品目(内500,000品目が在庫品、500,000品目がバーチャル品)
これらの化合物は、製薬・バイオテクノロジー・農薬等の業界で広く使われております。

Fragment Library
フラグメント ライブラリー
名称 品目数 概要
General Fragment Library 45,026品目 
(2019.10 更新データ)
在庫化合物から選抜された、MW≦300、clogP≦3.0の条件を満たすフラグメント
Advanced Fragment set 12,152品目 
(2019.06 更新データ)
より厳密な"Rule of Three"フィルタに加え、物理化学的・構造的フィルタを追加し選抜されたGeneral Fragment Libraryのサブセット (他、MedChem/PAINS structureフィルタも適用) 
Fragment Libraries with Experimental Solubility 17,784品目 
(2019.10 更新データ)
200mMでDMSOに溶解するものを選抜した、Advanced Fragment setのサブセット (特定濃度のリン酸緩衝液への溶解性データも付随) 
Fsp3-enriched Fragment Library  16,074品目 
(2019.10 更新データ)
sp3炭素の割合 (Fsp3) が高い化合物のみを抜粋したGeneral Fragment Libraryのサブセット
Fsp3-enriched Fragment Library advanced 6,217品目 
(2019.12 更新データ)
より厳密な"Rule of three"フィルタに加え、TPSA 90Å2未満の化合物をカットし選抜されたFsp3-enriched Fragment Libraryのサブセット (他、問題のある化合物を排除する為、PAINS/Toxicophore/好ましくない官能基のフィルタも適用)
Ultimate Fragment Library 6,587品目 
(2020.02 更新データ)
極めて厳格な"Rule of Three"フィルタに加え、TPSA 80Å以下の化合物をカットし選抜されたフラグメント (他、問題のある化合物を排除する為、PAINS/Toxicophore/好ましくない官能基のフィルタも適用)
Covalent Fragment Library 4,021品目 
(2019.10 更新データ)
ターゲットタンパクのアミノ酸残基と共有結合する事が知られている置換基を含むフラグメント (反応性の強いもの・ノンドラッグライクなもの・好ましくないものを選択時に排除)
Covalent Fragment Library advanced set 2,456品目 
(2019.12 更新データ)
在庫品より"Rule of three"のフィルタを行い、Lys、Cys、Ser、His、Tyrと言った標的タンパク質の結合部位のアミノ酸残基や特定の構造フラグメント(官能基)5-9を選択し、作成されたサブセット。(他、PAINSフィルターを使用して、非常に反応性の高い求電子基と求核基をもつ分子<非選択的バインダー>と非薬物様コアをもつものを選択時に排除)
Specific Covalent Fragments 1,140品目 
(2019.06 更新データ)
-
Low MW Fragments 6,770品目 
(2019.10 更新データ)
MW100-225のレンジを見据え、複数の物理化学的フィルタを用い選抜されたGeneral Fragment Libraryのサブセット (他、MedChem/PAINS structureフィルタも適用)
Low MW Fragments advanced 5,346品目 
(2019.10 更新データ)
より厳密な物理化学的・構造的フィルタにより選抜されたLow MW Fragmentsのサブセット
Natural Product-like Fragment Library 3,148品目 
(2020.01 更新データ)
既知天然物情報を元にケモタイプを選定 (Scaffold Tree approach) し、それらの部分構造検索・類似構造検索 (85%~) により選抜されたフラグメント
PPI Fragment Library 3,882品目 
(2020.02 更新データ)
文献調査により割り出したパラメーターにより選抜をした、PPI Fragmentらしさを保有するフラグメント
Bromine Fragment Library 1,704品目 
(2019.10 更新データ)
MW≦350、clogP≦3.5の条件を満たし、分子内に一つだけBr原子を持つフラグメント
Bromine Fragment Library advanced set 1,094品目 
(2019.12 更新データ)
物理化学的・構造的フィルタを追加し、さらに絞り込みを行ったBromine Fragment Libraryのサブセット
3D fragements livrary 3,186品目 
(2019.12 更新データ)
物理化学的フィルターと分子の3次元性・多様性を評価する記述子を使用して選抜をした、ドラッグライクで3次元性の高いフラグメント
Fluorine Fragment Library 4,753品目 
(2019.11 更新データ)
在庫化合物から選抜された、19F NMR-based fragment screeningでの使用を指向したフラグメント
Fluorine Fragment Library advanced set 2,136品目 
(2019.06 更新データ)
物理化学的・構造的フィルタを追加し、さらに絞り込みを行ったFluorine Fragment Libraryのサブセット
Fluorine Fragment Cooktails 1,350品目 
(2020.02 更新データ)
スクリーニング結果の解釈を容易にする為、最も異なる19Fケミカルシフトを有するフラグメントを10種ずつセットした、19F NMR-based fragment screening用のフッ素フラグメントカクテル
Advanced Tangible Fragments 11,956品目 
(2019.06 更新データ)
FBDD用に特別にデザインされた、高い新規性を持つフラグメント (受注後合成品)
Diversity Set
ダイバーシティー セット
Pre-plated Diversity Sets​
物理化学的特性が最適となるよう選抜されたダイバーシティセット。
 
名称 品目数 概要
Diversity Set 5K 5,120品目
(2019.06 更新データ)
タニモト係数80%平均を満たす、1,742のシングルトンが含まれるダイバーシティセット
Diversity Set 10K 9,920品目 
(2019.06 更新データ)
タニモト係数80%平均を満たす、2,027のシングルトンが含まれるダイバーシティセット
Diversity Set 15K 15,040品目 
(2019.06 更新データ)
タニモト係数80%平均を満たす、2,136のシングルトンが含まれるダイバーシティセット
Diversity Set 20K 20,160品目 
(2019.06 更新データ)
タニモト係数80%平均を満たす、2,186のシングルトンが含まれるダイバーシティセット
Diversity Set 50K 50,240品目 
(2019.06 更新データ)
タニモト係数80%平均を満たす、7,957のシングルトンが含まれるダイバーシティセット
Biologically Active Compound Library
生物活性化合物ライブラリー
名称 品目数 概要
Biologically Active Compound Library 8,589品目
(2019.10 更新データ)
機能的・結合や生物学的なアッセイにてテストし、in vivoやin vitroにて生物活性が確認されたライブラリ
Natural Product-like Compound Library
ナチュラルプロダクトライク 化合物ライブラリー
名称 品目数 概要
Natural Product like Compounds library similarity search 913品目
(2020.02 更新データ)
Timetek, Specnet, Analyticon, Selleck の商用データベース参照し、タニモト85%類似品カットオフを適用したライブラリ
Natural Product like Compounds library chemoinformatics substructure search 2,029品目
(2020.02 更新データ)
Chemical descriptors calculation (7,300品目)と、natural-likeness scoring
(9,700品目)の2種類の方法を用いて分析し、重複したコレクションから得られた化合物のライブラリ
Targeted Library and Focused Library
ターゲット アンド フォーカスド ライブラリー
名称 品目数 概要
GPCR Targeted Library - -
Sharp-aimed Kinase Targeted Libraries - Aurora A, Aurora B, CDK2, c-Met(HGFR), ERK5(MAPK7), FGFR1 Tyrosine Kinase, JAK, MAP, PDK1, PI3K, PKA, ROCK, Tyrosine, VGFR-2の各Kinase Focused Libraryを展開
Nuclear Receptors Targeted Library 5,100品目
(2019年12月データ)
-
Aquaporins Targeted Library 2,000品目
(2019年12月データ)
-
Deubiquitinase Targeted Libraries 417品目
(2019年12月データ)
-
Phosphodiesterase 10(PDE10)
Targeted Library
- -
PPI Targeted Libraries (Receptor-based) Magi1_Pdzd1 : 2,075品目
(2019.08 更新データ)
PAINS、および毒性・その他望ましくない化合物を排除する構造フィルター、またLipinskiルール・Veberルールを適用し絞り込んだLife Chemicals社の在庫コレクションを用い、PDZドメイン含有タンパク質に対してドッキング検索を行った化合物群
Psd_95_Pdzd2_1qlc : 1,607品目
(2019.08 更新データ)
Psd_95_Pdzd2_2ka9 : 994品目
(2019.08 更新データ)
Epigenetic Targeted Libraries - -
Chelator Focused Library 5,729品目
(2020.01 更新データ)
-
Matrix Metalloproteinase Focused Library 2,068品目
(2020.01 更新データ)
-
​NMDA Targeted Library    
Agro Chemical Libraries Insecticides: 1,800品目
Microbiocides: 1,900品目
Herbicides: 7,700品目
Fungicides: 1,000品目
(2020.01 更新データ)
HTS化合物コレクションを物理化学的特性と構造的な特徴にて評価し作成されたコレクション。農薬化合物として知られる参照セットに対してタニモト係数80%の閾値にて類似サーチ、部分構造検索、その後種類毎の部分構造コアを文献やオンラインデータベースより抽出
Antibacterial Library 5,368品目
(2020.02 更新データ)
病原菌の治療にて活性を有する化合物セットを用いて類似性検索を行いデザインされたライブラリ
Anticancer Library 6,346品目
(2020.02 更新データ)
ChEMBL やBindingDB上の抗腫瘍活性を有する化合物を参照し、HTS化合物コレクションにタニモト85%類似品カットオフを適用したライブラリ
Anti-HCV Library 15,797品目
(2020.02 更新データ)
NS3、Core protein、LYPLA1のウイルスに対して活性のある化合物を、MDL Public keysやタニモト90%類似品カットオフを適用したライブラリ
Anti-inflammatory Library 1,363品目
(2020.02 更新データ)
抗炎症剤として潜在的な化合物を、ドッキングスクリーニング法を用いて抽出しており、シグナル伝達中間体(シトキネス, ホスファチジルイノシトール, プロスタグランジン,トロンボキサン, スフィンゴシン-1-ホスファート等)の様々なステージでの生産や分解をカバーしているライブラリ
Antiprotozoal Library 4,480品目
(2020.02 更新データ)
 
Antituberculosis Libraries 3,625品目
(2020.02 更新データ)
 
Antiviral Libraries Combined Ligand Based and Structure based Approaches: 3,573品目
2D similarity: 18,047品目
(2020.02 更新データ)
 
Ligand-based Focused Libraries
名称 品目数 概要
Glutamate Receptors Focused Library - -
Kinase Focused Similarity Search Library - -
Bioactive Compounds - -
Veterinary Library - -
Ion Channels Focused Libraries - -
PPI Forcused Libraries (Ligand-based) Machine Learning (Decision Tree) Method : 2,548品目
(2019.08 更新データ)
PPI阻害剤の特性を見出す方法として有用である事が知られているマシンラーニング法 (decision tree, DT) を使用し絞り込みを行った化合物群
2D Similarity Search to Binding DB and Pubmed DB : 22,166品目
(2019.08 更新データ)
Binding DBとPubmed DBを使用しtoll-like receptor 4, Hepatitis C virus core protein (二量体化阻害), Tyrosine-protein kinase TYRO11, runt-related transcription factor 1 isoform AML1c, core-binding factor beta subunit isoform 1, mitogen-activated protein kinase 2 (MAP2), mitogen-activated protein kinase 3 (MAP3)に対するリファレンスセットを構築し、LifeChemicals社の在庫化合物に対しMDL public keysとTanimoto similarity (類似度90%) にて 絞込みを行った化合物郡
2D Similarity Search to Timbal DB : 1,486品目
(2019.08 更新データ)
在庫化合物に対しタニモト係数85%の閾値でTimbal DBの2D fingerprint類似検索を行い絞り込みを行った化合物群
Kinase Screening Library - -
Protease LASSO ScreeningLibraries - -
Phosphatase Focused Library - -
Protease Focused Library - -
ATPase Focused Libraries - -
Helicase Focused Library - -
Polymerase Focused Libraries - -
RNA Focused Library 3,495品目
(2019.07 更新データ)
2つのリガンドベースアプローチで設計されたRNA結合活性が期待される化合物群
Epigenetic Focused Library - -
Cysteine Protease Focused - -
Peptidomimetics Library - -
Caspase Focused Library - -
CYP Inhibitors Library - -
Cheminformatics-based Libraries
名称 品目数 概要
Covalent Inhibitors Library 11,361品目
(2019.07 更新データ)
標的タンパク:Lys、Cys、Ser、Asp、Glu および Tyr の結合部位においてアミノ酸残基と共有結合を形成する事が知られている特定の構造フラグメント (官能基) の情報を元に絞り込まれた化合物群
Cysteine Focused Covalent Inhibitors 1,383品目
(2019.07 更新データ)
活性部位のシステイン残基と可逆的または不可逆的に反応する可能性がある構造部分に基づいて絞り込まれた化合物群
Serine Focused Covalent Inhibitors 1,799品目
(2019.07 更新データ)
タンパクの結合部位にあるセリン残基と共有結合を形成することが報告されている特定の構造フラグメント (官能基) とドラッグライクフィルターを組み合わせて絞り込まれた化合物群
CNS Library - -
CUTE Targeted Libraries - -
PPI Focused Library(“Rule of Four”) 4,283品目
(2019.08 更新データ)
X.Morelli氏・R.Bourgeas氏により行われた研究に基づき作成されたライブラリーで、2P2Iデータセットを分析する事により決定された「Rule of Four」と称される構造的および化学的特徴に基づき絞り込まれた化合物群
 
DEL (DNA Encoded Library) related products
DNAエンコードライブラリー関連商品
Building Blocks for DEL Synthesis
品目数:6,758品目 (2019.07更新データ)
DEL合成において使用する事が可能なビルディングブロックおよびスキャフォールドを多く取り扱っております。

・Mono-functionalised Building Blocks
・Di-functionalised Building Blocks
・Tri-functionalised Building Blocks

データベースや詳細な資料が必要な場合は、是非こちらよりお問合せ下さい。
https://www.namiki-s.co.jp/inquiry/service.php​

 
 

施設・設備

有機合成、コンビケム、QCや保管等に最も適している設備が揃っております。

NMR Lab

Equipment
  • 3 spectrometer consoles ready for 1H, 13C, 19F, 29Si, 31P measurements and advanced 2D NMR techniques such as COSY, NOESY, HMQC, HSQC, INADEQUATE etc.
  • Varian® GEMINI2000 400 MHz with an Oxford Instruments superconducting magnet
  • Varian® VXR-300 300 MHz
  • Varian® Gemini 200 MHz
Capacity 200+ 1H NMR spectra daily.


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