Building Blocks
合成用試薬（ビルディングブロック）

品目数 62,000品目以上（内11,000品目が在庫品、50,000品目がバーチャル品）
毎月新しいBuilding Blocksが追加されています!!
※リクエストに応じ、バルク量での供給も対応が可能です。

Screening (HTS) Compounds
スクリーニング化合物

品目数 1,000,000品目（内500,000品目が在庫品、500,000品目がバーチャル品）
これらの化合物は、製薬・バイオテクノロジー・農薬等の業界で広く使われております。

 

Fragment Library
フラグメント ライブラリー

名称	品目数	概要
General Fragment Library	61,523品目 (2022年6月更新データ)	在庫化合物から選抜された、MW≦300、clogP≦3.0の条件を満たすフラグメント
Advanced Fragment set	7,965品目 (2022年8月更新データ)	より厳密な"Rule of Three"フィルタに加え、物理化学的・構造的フィルタを追加し選抜されたGeneral Fragment Libraryのサブセット (他、MedChem/PAINS structureフィルタも適用)
Fragment Libraries with Experimental Solubility	22,539品目 (2022年4月更新データ)	200mMでDMSOに溶解するものを選抜した、Advanced Fragment setのサブセット (特定濃度のリン酸緩衝液への溶解性データも付随)
Fsp3-enriched Fragment Library	19,976品目 (2021年11月更新データ)	sp3炭素の割合 (Fsp3) が高い化合物のみを抜粋したGeneral Fragment Libraryのサブセット

Diversity Set
ダイバーシティー セット

Pre-plated Diversity Sets​

物理化学的特性が最適となるよう選抜されたダイバーシティセット。
 

名称	品目数	概要
Diversity Set 5K	5,120品目 (2019.06 更新データ)	タニモト係数80%平均を満たす、1,742のシングルトンが含まれるダイバーシティセット
Diversity Set 10K	9,920品目  (2019.06 更新データ)	タニモト係数80%平均を満たす、2,027のシングルトンが含まれるダイバーシティセット
Diversity Set 15K	15,040品目  (2019.06 更新データ)	タニモト係数80%平均を満たす、2,136のシングルトンが含まれるダイバーシティセット
Diversity Set 20K	20,160品目  (2019.06 更新データ)	タニモト係数80%平均を満たす、2,186のシングルトンが含まれるダイバーシティセット
Diversity Set 50K	50,240品目  (2019.06 更新データ)	タニモト係数80%平均を満たす、7,957のシングルトンが含まれるダイバーシティセット

Biologically Active Compound Library
生物活性化合物ライブラリー

名称	品目数	概要
Biologically Active Compound Library	8,589品目 (2019.10 更新データ）	機能的・結合や生物学的なアッセイにてテストし、in vivoやin vitroにて生物活性が確認されたライブラリ

Natural Product-like Compound Library
ナチュラルプロダクトライク 化合物ライブラリー

名称	品目数	概要
Natural Product like Compounds library similarity search	913品目 (2020.02 更新データ)	Timetek, Specnet, Analyticon, Selleck の商用データベース参照し、タニモト85％類似品カットオフを適用したライブラリ
Natural Product like Compounds library chemoinformatics substructure search	2,029品目 (2020.02 更新データ）	Chemical descriptors calculation (7,300品目)と、natural-likeness scoring (9,700品目)の2種類の方法を用いて分析し、重複したコレクションから得られた化合物のライブラリ

Targeted Library and Focused Library
ターゲット アンド フォーカスド ライブラリー

名称	品目数	概要
GPCR Targeted Library	8,543品目	-
Sharp-aimed Kinase Targeted Libraries	-	Aurora A, Aurora B, CDK2, c-Met(HGFR), ERK5(MAPK7), FGFR1 Tyrosine Kinase, JAK, MAP, PDK1, PI3K, PKA, ROCK, Tyrosine, VGFR-2の各Kinase Focused Libraryを展開
Nuclear Receptors Targeted Library	5,100品目 (2019年12月データ)	-
Aquaporins Targeted Library	2,000品目 (2019年12月データ)	-
Deubiquitinase Targeted Libraries	417品目 (2019年12月データ)	-
Phosphodiesterase 10(PDE10) Targeted Library	-	-
PPI Targeted Libraries (Receptor-based)	Magi1_Pdzd1 : 2,075品目 (2019.08 更新データ)	PAINS、および毒性・その他望ましくない化合物を排除する構造フィルター、またLipinskiルール・Veberルールを適用し絞り込んだLife Chemicals社の在庫コレクションを用い、PDZドメイン含有タンパク質に対してドッキング検索を行った化合物群
	Psd_95_Pdzd2_1qlc : 1,607品目 (2019.08 更新データ)
	Psd_95_Pdzd2_2ka9 : 994品目 (2019.08 更新データ)
Epigenetic Targeted Libraries	-	-
Chelator Focused Library	5,729品目 (2020.01 更新データ)	-
Matrix Metalloproteinase Focused Library	2,068品目 (2020.01 更新データ)	-
​NMDA Targeted Library
Agro Chemical Libraries	Insecticides: 1,800品目 Microbiocides: 1,900品目 Herbicides: 7,700品目 Fungicides: 1,000品目 (2020.01 更新データ)	HTS化合物コレクションを物理化学的特性と構造的な特徴にて評価し作成されたコレクション。農薬化合物として知られる参照セットに対してタニモト係数80%の閾値にて類似サーチ、部分構造検索、その後種類毎の部分構造コアを文献やオンラインデータベースより抽出
Antibacterial Library	5,368品目 (2020.02 更新データ）	病原菌の治療にて活性を有する化合物セットを用いて類似性検索を行いデザインされたライブラリ
Anticancer Library	6,346品目 (2020.02 更新データ)	ChEMBL やBindingDB上の抗腫瘍活性を有する化合物を参照し、HTS化合物コレクションにタニモト85％類似品カットオフを適用したライブラリ
Anti-HCV Library	15,797品目 (2020.02 更新データ)	NS3、Core protein、LYPLA1のウイルスに対して活性のある化合物を、MDL Public keysやタニモト90％類似品カットオフを適用したライブラリ
Anti-inflammatory Library	1,363品目 (2020.02 更新データ)	抗炎症剤として潜在的な化合物を、ドッキングスクリーニング法を用いて抽出しており、シグナル伝達中間体(シトキネス, ホスファチジルイノシトール, プロスタグランジン,トロンボキサン, スフィンゴシン-1-ホスファート等)の様々なステージでの生産や分解をカバーしているライブラリ
Antiprotozoal Library	4,480品目 (2020.02 更新データ)
Antituberculosis Libraries	3,625品目 (2020.02 更新データ)
Antiviral Libraries	Combined Ligand Based and Structure based Approaches: 3,573品目 2D similarity: 18,047品目 (2020.02 更新データ)

Ligand-based Focused Libraries

名称	品目数	概要
Glutamate Receptors Focused Library	-	-
Kinase Focused Similarity Search Library	-	-
Bioactive Compounds	-	-
Veterinary Library	-	-
Ion Channels Focused Libraries	-	-
PPI Forcused Libraries (Ligand-based)	Machine Learning (Decision Tree) Method : 2,548品目 (2019.08 更新データ)	PPI阻害剤の特性を見出す方法として有用である事が知られているマシンラーニング法 (decision tree, DT) を使用し絞り込みを行った化合物群
	2D Similarity Search to Binding DB and Pubmed DB : 22,166品目 (2019.08 更新データ)	Binding DBとPubmed DBを使用しtoll-like receptor 4, Hepatitis C virus core protein (二量体化阻害), Tyrosine-protein kinase TYRO11, runt-related transcription factor 1 isoform AML1c, core-binding factor beta subunit isoform 1, mitogen-activated protein kinase 2 (MAP2), mitogen-activated protein kinase 3 (MAP3)に対するリファレンスセットを構築し、LifeChemicals社の在庫化合物に対しMDL public keysとTanimoto similarity (類似度90%) にて 絞込みを行った化合物郡
	2D Similarity Search to Timbal DB : 1,486品目 (2019.08 更新データ)	在庫化合物に対しタニモト係数85%の閾値でTimbal DBの2D fingerprint類似検索を行い絞り込みを行った化合物群
Kinase Screening Library	-	-
Protease LASSO ScreeningLibraries	-	-
Phosphatase Focused Library	-	-
Protease Focused Library	-	-
ATPase Focused Libraries	-	-
Helicase Focused Library	-	-
Polymerase Focused Libraries	-	-
RNA Focused Library	3,495品目 (2019.07 更新データ)	2つのリガンドベースアプローチで設計されたRNA結合活性が期待される化合物群
Epigenetic Focused Library	-	-
Cysteine Protease Focused	-	-
Peptidomimetics Library	-	-
Caspase Focused Library	-	-
CYP Inhibitors Library	-	-

Cheminformatics-based Libraries

名称	品目数	概要
Covalent Inhibitors Library	11,361品目 (2019.07 更新データ)	標的タンパク：Lys、Cys、Ser、Asp、Glu および Tyr の結合部位においてアミノ酸残基と共有結合を形成する事が知られている特定の構造フラグメント (官能基) の情報を元に絞り込まれた化合物群
Cysteine Focused Covalent Inhibitors	1,383品目 (2019.07 更新データ)	活性部位のシステイン残基と可逆的または不可逆的に反応する可能性がある構造部分に基づいて絞り込まれた化合物群
Serine Focused Covalent Inhibitors	1,799品目 (2019.07 更新データ)	タンパクの結合部位にあるセリン残基と共有結合を形成することが報告されている特定の構造フラグメント (官能基) とドラッグライクフィルターを組み合わせて絞り込まれた化合物群
CNS Library	-	-
CUTE Targeted Libraries	-	-
PPI Focused Library(“Rule of Four”)	4,283品目 (2019.08 更新データ)	X.Morelli氏・R.Bourgeas氏により行われた研究に基づき作成されたライブラリーで、2P2Iデータセットを分析する事により決定された「Rule of Four」と称される構造的および化学的特徴に基づき絞り込まれた化合物群

 

DEL (DNA Encoded Library) related products
DNAエンコードライブラリー関連商品

Building Blocks for DEL Synthesis

品目数：6,758品目 (2019.07更新データ)
DEL合成において使用する事が可能なビルディングブロックおよびスキャフォールドを多く取り扱っております。

・Mono-functionalised Building Blocks
・Di-functionalised Building Blocks
・Tri-functionalised Building Blocks

データベースや詳細な資料が必要な場合は、是非こちらよりお問合せ下さい。
https://www.namiki-s.co.jp/inquiry/service.php​

 

有機合成、コンビケム、QCや保管等に最も適している設備が揃っております。

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